Июнь — начинается конфликт между председателем ДУМ Центрально-Европейского региона России и Совета муфтиев России муфтием Равилем Гайнутдином и татарским бизнесменом и меценатом, председателем ДУМ Сибири Р.Ж.Баязитовым. Баязитов переходит на сторону Ц ДУМ и становится советником председателя ЦДУМ верховного муфтия Талгата Таджуддина по национальным вопросам.
8-10 августа — в Тобольске проходит I Конференция мусульман Сибири и Дальнего Востока, итогом которой становится образование Духовного управления мусульман Сибири и Дальнего Востока (Межрегионального духовного управления Сибири и Дальнего Востока). Председателем нового ДУМа избирается бывший председатель ВКЦДУМР Нафигулла Аширов, впоследствии получивший титул «верховный муфтий Азиатской части России». Его заместителями становятся генеральный директор Исламского культурного центра России Абдул-Вахед Ниязов и председатель ДУМ Тюменской области Галимзян Бикмуллин.
Октябрь — ДУМ Сибири выводится из состава Совета муфтиев России. Начинается противостояние ДУМ Сибири и Межрегионального духовного управления Сибири и Дальнего Востока.
1998
14- 15 февраля - в Казани проходит III Съезд мусульман Татарстана, впоследствии названный Объединительным. Действующие в Татарстане мусульманские централизованные структуры объединяются в единое ДУМ Республики Татарстан, председателем которого избирается первый заместитель Габдуллы Галиуллина Гусман Исхаков. Председатели ДУМ Татарстана юрисдикции ЦДУМ муфтий Фарид Салман Хайдаров и ДУМ Республики Татарстан муфтий Габдулла Га- лиулла объявляют состоявшийся Съезд инспирированным правительством Татарстана, а его результаты — не имеющими юридической силы.
18 марта — на Пленуме ДУМ Республики Татарстан муфтии Фарид Салман Хайдаров и Габдулла Галиуллин признают легитимность муфтия Гусмана Исхакова и снимают с себя полномочия. Также на Пленуме принимается устав ДУМ Республики Татарстан (ДУМ РТ) и решаются принципиальные вопросы, связанные с его организационной структурой.
25 апреля — V Съезд мусульман Адыгеи избирает новым муфтием ДУМ Республики Адыгея Аскарбия Хачемизова.
20-21 мая — в Махачкале проходят беспорядки, главными организаторами которых выступают братья Хачилаевы. Минюст России начинает работу по ликвидации Союза мусульман России.
4 июня — в Москве проходит заседание Совета послов арабских государств, которое осуждает деятельность генерального директора Абдул-Вахеда Ниязова и ряда его сторонников.
15 июля — банда полевого командира Арби Бараева атакует казармы Гудермесского батальона национальной гвардии Чечни. В Чечне начинается вооруженное противостояние ваххабитов и сторонников традиционного ислама.
2 августа — в Ингушетии совместным решением руководства республики, имамов мечетей и религиозных авторитетов запрещается ваххабизм.
16 августа — ваххабиты дагестанских сел Карамахи, Чабан-махи и Кадар объявляют о создании на территории Кадарского анклава «отдельной исламской территории», живущей по законам шариата и не подчиняющейся российским властям.
17 августа — на Конференции Духовных управлений мусульман Северного Кавказа в Назрани принимается решение о создании Координационного центра мусульман Северного Кавказа. Его председателем избирается муфтий Ингушетии Магомед Албогачиев.
21 августа — в результате террористического акта в Махачкале погибает председатель ДУМ Дагестана Саид-Магомед Абу- бакаров.
18 сентября —Государственная Дума снимает депутатскую неприкосновенность с Надиршаха Хачилаева, обвиняемого в организации массовых беспорядков в Махачкале.
29 августа — новым муфтием Дагестана избирается Ахмад Абдуллаев.
Ноябрь — в Омске проходит Учредительная конференция Межрегионального духовного управление мусульман Сибири и Дальнего Востока (МДУМСДВ). МДУМСДВ преобразуется в ДУМ Азиатской части России (ДУМАЧР).
10 ноября — в Москве учреждается общероссийское политическое общественное движение «Рефах».
17 ноября — председатель ДУМ «Ассоциация мечетей» муфтий Махмуд Велитов заявляет о сложении своих полномочий и присоединении к ЦДУМ.
24-25 ноября — в Москве проходит расширенное совместное заседание Совета муфтиев России и ВКЦДУМР, итогом которого становится их объединение. ВКЦДУМР фактически прекращает свое существование.
23 декабря — на встрече глав и представителей Русской Православной Церкви, ЦДУМ, Совета муфтиев России, Конгресса еврейских религиозных организаций и объединений и Буддийской традиционной сангхи России принимается решение об образовании Межрелигиозного совета России.
1999
18 января — ДУМ Центрально-Европейского региона России (ДУМЦЕР) проходит перерегистрацию и меняет название на ДУМ Европейской части России (ДУМЕР).
12 февраля — в Омске открывается Съезд мусульман Сибири, в котором принимает участие председатель ЦДУМ верховный муфтий Талгат Таджуддин. Съезд осуждает «раскольнические действия ДУМАЧР».
13- 14 февраля — в Тюмени проходит II Форум ДУМАЧР. Происходит окончательное формирование административно- территориальной структуры этого муфтията.
Начало апреля — сторонники ДУМЕР устанавливают контроль над Исторической мечетью в Москве.
9 апреля — главный цензор ДУМ РТ Фарид Салман Хайдаров заявляет о выходе из этой структуры. Вскоре он создает собственный муфтият — Региональное ДУМ Татарстана в составе
ЦДУМ и становится его муфтием. Начинается борьба между ДУМ РТ и ЦДУМ.
8 июня — в г. Булгар (Республика Татарстан) проходит VIII Внеочередной съезд ЦДУМ, приуроченный к 1110-й годовщине со дня принятия ислама Волжской Булгарией. На Съезде утверждаются типовые уставы ЦДУМ, региональных ДУМов и махаллей (приходов).
6 августа — начинается вторжение чеченских группировок в Дагестан. Ваххабиты Кадарского анклава вступают в боевые действия на стороне боевиков.
Август — движение «Рефах» входит в состав политического блока «Единство» и становится его «блокобразующей партией».
27 августа — в Москве проходит Учредительный съезд Общероссийского Союза общественных объединений «Меджлис». Новое движение призывает все мусульманские партии России объединиться под его эгидой для участия в парламентских выборах.
9 и 13 сентября — террористы взрывают дома на улице Гурьянова и на Каширском шоссе в Москве. Одним из главных подозреваемых в организации террористических актов становится уроженец Узбекистана Денис Сайтаков, шакирд (студент) набережночелнинского медресе «Иолдыз».
1 б сентября — на сессии дагестанского парламента объявляется о запрещении ваххабизма на территории Республики Дагестан.
2 октября — сотрудниками правоохранительных органов г. Набережные Челны задерживается имам-хатыб центральной мечети «Таубе», выпускник медресе «Иолдыз» Айрат Вахитов. Ему предъявляется обвинение по статье 208, часть вторая Уголовного кодекса России — участие в вооруженных формированиях, не предусмотренных федеральным законом. Вскоре еще 10 бывших студентов «Иолдыза» объявляются в розыск в связи с их участием в чеченских бандформированиях.
2 октября — в Уфе проходит Совет муфтиев ЦДУМ, приуроченный к торжествам по случаю 10-летия Исламского института им. Ризаетдина бин Фахретдина. По итогам Совета принимается обращение, акцентирующее внимание на прогрессирующем распространении ваххабизма в Российской Федерации.
б октября — сотрудники ФСБ задерживают находящегося в федеральном розыске председателя Союза мусульман России Надиршаха Хачилаева.
8- 9 октября — представители ДУМ РТ и Совета муфтиев России совершают инспекционную поездку в «Йолдыз».
10 октября — решением президента Чеченской Республики Ичкерия председатель ДУМ Чеченской Республики Ичкерия муфтий Ахмад Кадыров освобождается от занимаемой должности.
15 октября — на съезде ДУМ Тюменской области председатель ДУМ ТО муфтий Галимзян Бикмуллин заявляет о выходе своего муфтията из ДУМ Азиатской части России.
16 октября — президент Чеченской Республики Ичкерия Аслан Масхадов объявляет муфтия Чечни Ахмада Кадырова врагом чеченского народа с формулировкой «подлежит уничтожению».
15 ноября — Совет муфтиев России принимает заявление, направленное против верховного муфтия ЦДУМ Талгата Таджуд- дина и председателя ДУМ Сибири Р.Ж.Баязитова. Начинается новый виток борьбы между ЦДУМ И СМР.
1 декабря — террористы взрывают несколько веток магистрального газопровода на границе Республики Татарстан и Кировской области. Организатором террористического акта выступает группа татарстанских ваххабитов, среди которых есть выпускники набережночелнинского медресе «Йолдыз».
2000
24 февраля — на базе ДУМ РТ и Центрального ДУМ Ульяновской области (образовано летом 1999 г.) создается новая централизованная структура — Ассоциация мусульманских религиозных организаций «Казанский муфтият», призванная расширить зону юрисдикции ДУМ РТ до территории всего Поволжья, а впоследствии и всей страны.
15 марта — Ассоциация мусульманских религиозных организаций «Казанский муфтият» входит в состав Совета муфтиев России (образованное в 1998 г. ДУМ РТ в Совет муфтиев России не входило).
23 марта — в Уфе проходит совместное заседание Совета муфтиев Ц ДУМ и Общероссийского союза общественных объединений «Меджлис». ЦДУМ и «Меджлис» заключают стратегический союз.
