Эд Йонг – Вселенная внутри нас. Как микробы обогащают наш взгляд на жизнь (страница 63)

Спасибо Мартину Блейзеру, Сету Борденстайну, Томасу Бошу, Джону Криану, Анжеле Дуглас, Джеффу Гордону, Грегу Херсту, Николь Кинг, Нику Лейну, Рут Лей, Дэвиду Миллзу, Нэнси Моран, Форесту Роуэру, Марку Тейлору и Марку Андервуду за экскурсии по лабораториям и за обстоятельные и интересные рассказы; Нелл Бекиэрес за то, что лично познакомила меня с моллюском; Дейву О’Доннеллу, Марии Карлссон и Джастину Серуго за то, что дали мне подержать стерильных мышек; Биллу Ван Бонну за экскурсию по Аквариуму Шедда; Элизабет Бик, чей «Дайджест микробиома» оказался лучшим способом не отставать от новостей микробиологии; историкам Яну Саппу и Фанке Сангодейи, чьи книги и диссертация позволили дополнить мою работу немаловажными фактами из истории этой области; активному сообществу генетиков и микробиологов в «Твиттере», рассуждения и критика которых помогли мне исправить недочеты и не давали расслабиться; Николь Дюбилье и Неду Руби за то, что позволили журналисту – фу-у-у! – завалиться на авторитетнейшую Гордоновскую конференцию, посвященную симбиозу животных и микробов, и провести там потрясающую неделю, полную науки, походов и, увы, забивания кукурузы в дырку[423].

К сожалению, многие из тех, кто мне помог, так и не попали на страницы этой книги. Микробиология охватывает много разных тем, и одной книги явно недостаточно, чтобы рассказать о ней. Хочу заметить, что исследования, описанные в книге и приписываемые одному-двум людям, стали результатом работы множества студентов, молодых ученых и соавторов. Я старался по возможности компенсировать недосказанности в сносках, но, так или иначе, я сердечно благодарю их, сочувствую и напоминаю, что об этих темах я пишу далеко не в последний раз.

И наконец, я от всей души благодарю Уилла Фрэнсиса, своего агента. Когда-то давно приятель сказал мне, что хороший агент поможет привести мысли в порядок, продать книгу или получить необходимое продвижение и публичность, но сразу с тремя задачами не справится никто. Так вот, Уилл справился. Он много лет уговаривал меня сесть за написание книги, в январе 2014 года любезно проигнорировал мое письмо, в котором я твердо заверил его, что не собираюсь ничего писать и вообще отстань уже; через три недели любезно прочел письмо, в котором я передумал и взял свои слова обратно, и помог мне облечь смутные и расплывчатые мысли в надежный план. Он – настоящий друг, если не симбионт, и страницы этой книги многим ему обязаны.

Список литературы

Abbott, A.C. (1894) The Principles of Bacteriology (Philadelphia: Lea Bros & Co.).

Acuna, R., Padilla, B.E., Florez-Ramos, C.P., et al. (2012) ‘Adaptive horizontal transfer of a bacterial gene to an invasive insect pest of coffee’, Proc. Natl. Acad. Sci. 109, 4197–4202.

Adams, A.S., Aylward, F.O., Adams, S.M., et al. (2013) ‘Mountain pine beetles colonizing historical and naive host trees are associated with a bacterial community highly enriched in genes contributing to terpene metabolism’, Appl. Environ. Microbiol. 79, 3468–3475.

Adams, R.I., Bateman, A.C., Bik, H.M., Meadow, J.F. (2015) ‘Microbiota of the indoor environment: a meta-analysis’, Microbiome 3.

Alang, N., Kelly, C.R. (2015) ‘Weight gain after fecal microbiota transplantation’, Open Forum Infect. Dis. 2, ofv004–ofv004.

Alcaide, M., Messina, E., Richter, M., et al. (2012) ‘Gene sets for utilization of primary and secondary nutrition supplies in the distal gut of endangered Iberian lynx’, PLoS ONE 7, e51521.

Alcock, J., Maley, C.C., Aktipis, C.A. (2014) ‘Is eating behavior manipulated by the gastrointestinal microbiota? Evolutionary pressures and potential mechanisms’, BioEssays 36, 940–949.

Alegado, R.A., King, N. (2014) ‘Bacterial influences on animal origins’, Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 6, a016162–a016162.

Alegado, R.A., Brown, L.W., Cao, S., et al. (2012) ‘A bacterial sulfonolipid triggers multicellular development in the closest living relatives of animals’, Elife 1, e00013.

AlFaleh, K., Anabrees, J. (2014) ‘Probiotics for prevention of necrotizing enterocolitis in preterm infants’, in Cochrane Database of Systematic Reviews, The Cochrane Collaboration (Chichester, UK: John Wiley & Sons).

Alivisatos, A.P., Blaser, M.J., Brodie, E.L., et al. (2015) ‘A unified initiative to harness Earth’s microbiomes’, Science 350, 507–508.

Allen, S.J., Martinez, E.G., Gregorio, G.V., Dans, L.F. (2010) ‘Probiotics for treating acute infectious diarrhoea’, in Cochrane Database of Systematic Reviews, The Cochrane Collaboration (Chichester, UK: John Wiley & Sons).

Allison, M.J., Mayberry, W.R., Mcsweeney, C.S., Stahl, D.A. (1992) ‘Synergistes jonesii, gen. nov., sp.nov.: a rumen bacterium that degrades toxic pyridinediols’, Syst. Appl. Microbiol. 15, 522–529.

The Allium (2014) ‘New Salmonella diet achieves ‘amazing’ weight-loss for microbiologist’.

Altman, L.K. (1993) ‘Dr. Denis Burkitt is dead at 82; thesis changed diets of millions’, New York Times.

Amato, K.R., Leigh, S.R., Kent, A., et al. (2015) ‘The gut microbiota appears to compensate for seasonal diet variation in the wild black howler monkey (Alouatta pigra)’, Microb. Ecol. 69, 434–443.

American Chemical Society (1999) ‘Alexander Fleming Discovery and Development of Penicillin’.

Amphibian Ark (2012) ‘Chytrid fungus – causing global amphibian mass extinction’.

Anderson, D. (2014) ‘Still going strong: Leeuwenhoek at eighty’, Antonie Van Leeuwenhoek 106, 3–26.

Anderson, J.L., Edney, R.J., Whelan, K. (2012) ‘Systematic review: faecal microbiota transplantation in the management of inflammatory bowel disease’, Aliment. Pharmacol. Ther.36, 503–516.

Anukam, K.C., Reid, G. (2007) ‘Probiotics: 100 years (1907–2007) after Elie Metchnikoff’s observation’, in Communicating Current Research and Educational Topics and Trends in Applied Microbiology (FORMATEX).

Archibald. J. (2014) One Plus One Equals One: Symbiosis and the Evolution of Complex Life (Oxford: Oxford University Press).

Archie, E. A. Theis, K.R. (2011) ‘Animal behaviour meets microbial ecology’, Anim. Behav. 82, 425–436.

Aroniadis, O.C., Brandt, L.J. (2014) ‘Intestinal microbiota and the efficacy of fecal microbiota transplantation in gastrointestinal disease’, Gastroenterol. Hepatol. 10, 230–237.

Arrieta, M-C., Stiemsma, L.T., Dimitriu, P.A., et al. (2015) ‘Early infancy microbial and metabolic alterations affect risk of childhood asthma’, Sci. Transl. Med. 7, 307ra152.

Asano, Y., Hiramoto, T., Nishino, R., et al. (2012) ‘Critical role of gut microbiota in the production of biologically active, free catecholamines in the gut lumen of mice’, AJP Gastrointest. Liver Physiol. 303, G1288–G1295.

Atarashi, K., Tanoue, T., Shima, T., et al. (2011) ‘Induction of colonic regulatory T cells by indigenous Clostridium species’, Science 331, 337–341.

Atarashi, K., Tanoue, T., Oshima, K., et al. (2013) ‘Treg induction by a rationally selected mixture of Clostridia strains from the human microbiota’, Nature 500, 232–236.

Aung, A. (2007) Feeding of Leucaena Mimosine on Small Ruminants: Investigation on the Control of its Toxicity in Small Ruminants (Göttingen: Cuvillier Verlag).

Bäckhed, F., Ding, H., Wang, T., et al. (2004) ‘The gut microbiota as an environmental factor that regulates fat storage’, Proc. Natl. Acad. Sci. 101, 15718–15723.

Bäckhed, F., Fraser, C.M., Ringel, Y., et al. (2012) ‘Defining a healthy human gut microbiome: current concepts, future directions, and clinical applications’, Cell Host Microbe12, 611–622.

Bäckhed, F., Roswall, J., Peng, Y., et al. (2015) ‘Dynamics and stabilization of the human gut microbiome during the first year of life’, Cell Host Microbe 17, 690–703.

Ballal, S.A., Veiga, P., Fenn, K., et al. (2015) ‘Host lysozyme-mediated lysis of Lactococcus lactis facilitates delivery of colitis-attenuating superoxide dismutase to inflamed colons’, Proc. Natl. Acad. Sci. 112, 7803–7808.

Barott, K.L., Rohwer, F.L. (2012) ‘Unseen players shape benthic competition on coral reefs’, Trends Microbiol. 20, 621–628.

Barr, J.J., Auro, R., Furlan, M., et al. (2013) ‘Bacteriophage adhering to mucus provide a non – host-derived immunity’, Proc. Natl. Acad. Sci. 110, 10771–10776.

Bates, J.M., Mittge, E., Kuhlman, J., et al. (2006) ‘Distinct signals from the microbiota promote different aspects of zebrafish gut differentiation’, Dev. Biol. 297, 374–386.

Baumann, P., Lai, C., Baumann, L., et al. (1995) ‘Mutualistic associations of aphids and prokaryotes: biology of the genus Buchnera’, Appl. Environ. Microbiol. 61, 1–7.

BBC (23 January 2015) The 25 biggest turning points in Earth’s history.

Beasley, D.E., Koltz, A.M., Lambert, J.E., et al. (2015) ‘The evolution of stomach acidity and its relevance to the human microbiome’, PLoS ONE 10, e0134116.

Beaumont, W. (1838) Experiments and Observations on the Gastric Juice, and the Physiology of Digestion (Edinburgh: Maclachlan & Stewart).

Becerra, J.X., Venable, G.X., Saeidi, V. (2015) ‘Wolbachia-free heteropterans do not produce defensive chemicals or alarm pheromones’, J. Chem. Ecol. 41, 593–601.

Becker, M.H., Walke, J.B., Cikanek, S., et al. (2015) ‘Composition of symbiotic bacteria predicts survival in Panamanian golden frogs infected with a lethal fungus’, Proc. R. Soc. B Biol. Sci. 282.