Макклой представил доказательства того, что ответственность за взрыв несут германские тайные агенты, после чего Гаагский арбитражный суд обязал Германию выплатить 26 млн долларов в качестве компенсации за ущерб. В целях расследования Макклой в течение ряда лет путешествовал по всей Европе и встречался с нацистскими бонзами, такими как Рудольф Гесс и Герман Геринг. В итоге Макклой стал специалистом в сфере спецслужб и в 1940 году был назначен экспертом по контрразведке в военном министерстве США, а в 1941 году стал помощником военного министра Генри Льюиса Стимсона (Henry Lewis Stimson), патологического русофоба, который в своё время выступал активным противником установления дипломатических отношений между США и СССР. Стимсон осуществлял надзор за созданием американской атомной бомбы, контролируя непосредственного руководителя «Манхэттенского проекта» бригадного генерала Лесли Гровса. При выборе целей для атомной бомбардировки Японии Гровс выступал за уничтожение Киото, однако Стимсон вычеркнул Киото из списка и заменил его на Нагасаки, поскольку в своё время, в 1893 году, провёл в Киото медовый месяц с Мэйбл Веллингтон Уайт (Mabel Wellington White), праправнучкой одного из отцов-основателей США Роджера Шермана (Roger Sherman).
Макклой осуществлял связь Стимсона с Госдепом и Объединённым комитетом начальников штабов (JCS), оказывая в этом качестве влияние на внешнюю политику США и планирование большинства военно-стратегических операций, в том числе и атомных бомбардировок японских городов. Поскольку в Военном министерстве Макклой курировал работу спецслужб, именно он создал в июне 1942 года Управление стратегических служб (OSS) внутри JCS как орган для координации разведывательно-диверсионной деятельности на территории противника. OSS явилось предшественником созданного в 1947 году Центрального разведывательного управления (ЦРУ).
С 1947 по 1949 год Макклой был президентом основанного в 1946 году Всемирного банка. Он стремился создать банку репутацию на Уолл-стрит и превратить его в мощный инструмент финансовой экспансии США в Европе и оружие борьбы против коммунистического движения в мире, что ему вполне удалось.
4 апреля 1949 года для «отражения советской угрозы» был создан агрессивный блок НАТО. По словам первого генсека НАТО барона Исмея (Hastings Lionel Ismay, 1st Baron Ismay), в годы Второй мировой войны начальника личного штаба Черчилля, уже весной 1945 года подготовившего план нападения на СССР (Operation Unthinkable), целью создания НАТО было keep the Soviet Union out, the Americans in, and the Germans down («держать Советский Союз вне (Европы), американцев — внутри, а немцев — в подчинённом положении»).
23 мая 1949 года на территориях, расположенных в американской, британской и французской зонах оккупации, сепаратным путём была провозглашена Федеративная Республика Германия (ФРГ). При этом ст. 23 Основного закона ФРГ в принятой редакции, перечислявшая земли ФРГ, устанавливала, что «в остальных частях Германии он (Основной закон) должен вступить в силу по их присоединении».
2 сентября 1949 года Макклой был назначен верховным комиссаром американской зоны оккупации Германии, а уже 15 сентября 1949 года первым федеральным канцлером Германии становится его родственник Конрад Аденауэр. С этого момента на территории ФРГ начинается быстрое сворачивание всех прцессов денацификации и возвращение нацистов к власти, но уже под патронажем США и в рамках общей концепции атлантизма, превращая НАТО в Четвёртый рейх.
31 января 1951 года Макклой объявил о помиловании осуждённых в Нюрнберге военных преступников. По согласованию с Консультативным советом по помилованию, так называемой группой Пека, Макклой резко сократил сроки наказания военным преступникам, в том числе крупнейшему нацистскому промышленнику Фридриху Флику (Friedrich Flick), фюреру военной экономики, владельцу концерна «Фридрих Крупп» Альфриду Круппу (Alfried Felix Alwyn Krupp von Bohlen und Halbach) и члену правления IG Farben Фрицу тер Мееру (Fritz ter Meer), что побудило Элеонору Рузвельт (Anna Eleanor Roosevelt) спросить Макклоя: «Почему мы освобождаем так много нацистов?» Более того, по предложению «группы Пека», Флику и Круппу полностью вернули их активы, которые были конфискованы в 1945 году. А ведь они были нажиты на производстве вооружения для убийства миллионов людей и использовании труда узников концлагерей. После досрочного освобождения Флик возродил свою империю, и к 1960 году снова стал богатейшим промышленником Германии. Вины своей он никогда не признавал. Крупп, который во время войны координировал деятельность военно-промышленных предприятий в Германии и оккупированных странах, вернул всё своё личное состояние и добился отмены постановления о разукрупнении концерна «Фридрих Крупп».
13 мая 1951 года в Германии был провозглашен федеральный закон, регулирующий правовые отношения лиц, подпадающих под действие ст. 131 Основного закона (правовые отношения лиц, состоявших на государственной службе на 8 мая 1945 года). Иначе этот закон называют «завершением денацификации», или всеобщей амнистией нацистов. Он гарантировал всем лицам с нацистским прошлым, за исключением небольшой группы главных военных преступников (которые таковыми уже давно не считались), возвращение на государственную службу и во все сферы общественной жизни. В результате, по некоторым оценкам, из более чем 1,5 млн военных преступников к ответственности были привлечены лишь 12 457, а осуждены — в подавляющем большинстве символически — 6329. К тому же все осуждённые преступники после амнистии 1951 года вышли на свободу и вернулись в политику, судебную систему, администрацию, полицию и университеты, нередко под вымышленными именами и с откорректированными биографиями. Например, в 1950‑х годах более двух третей руководящих сотрудников Федерального ведомства уголовной полиции (BKA) были бывшими членами СС. То же самое касается Федеральной разведывательной службы (BND) и Федерального ведомства по охране конституции (BfV), практически полностью укомплектованных бывшими офицерами абвера, гестапо, СД и СС.
Лев Александрович Безыменский, который во время войны был переводчиком разведотдела штаба Донского фронта (командующий Константин Константинович Рокоссовский) и принимал участие в допросах фельдмаршала Паулюса, рейхсмаршала Геринга, фельдмаршала Кейтеля и других немецких военачальников, в своей книге «Германские генералы — с Гитлером и без него» (1964) приводит разговор с одним из основателей партии ХДС (CDU) Вильгельмом Эльфесом (Wilhelm Elfes). Вот что рассказал немецкий политик:
— Вечером 2 января 1948 г. мы вели обычный разговор на различные, в том числе и политические, темы. И вдруг Аденауэр обратился ко мне:
— Господин Эльфес, что бы вы ответили, если бы вам поставили вопрос: что вы думаете о возможности войны против России?
— Войны? Зачем? — переспросил я.
— Чтобы немного оттеснить этих русских на Восток, — осторожно пояснил Аденауэр.
Как впоследствии признавался сам Аденауэр, он «в декабре 1948 г. вызвал к себе генерала Шпейделя и потребовал подготовить данные о соотношении сил на земном шаре, из которых вытекала бы необходимость… ремилитаризации Германии».
Генерал-лейтенант вермахта Ганс Шпайдель (Hans Speidel) был участником Первой мировой войны, в том числе битвы на Сомме, в 1932 году получил звание гауптмана разведоргана «Иностранные армии» (Т 3), в 1932 году направлен в Париж помощником военного атташе Германии, в 1940 году в звании подполковника был назначен начальником штаба оккупационных войск во Франции, в 1942 году был направлен на Восточный фронт начальником штаба V. армейского корпуса, затем армейской группы «Кемпф», в 1943 году в звании генерал-майора назначен начальником штаба группы армий «Юг», участвовал в Курской битве (операция «Цитадель»), в 1944 году — начальник штаба группы армий «В» во Франции. В 1958 году в ГДР вышел фильм «Операция “Тевтонский меч”», авторы которого на основании архивных документов обвиняют Шпайделя в организации убийства хорватскими усташами югославского короля Александра I в Марселе 9 октября 1934 года и в многочисленных военных преступлениях на территории СССР во время Великой Отечественной войны. 22 ноября 1955 года Шпайдель был назначен начальником управления вооружённых сил министерства обороны ФРГ, с 1 апреля 1957 по сентябрь 1963 года занимал должность командующего объединёнными сухопутными войсками НАТО в Центральной Европе.
«29 августа 1950 г., тот же самый д-р Аденауэр посетил верховного комиссара США Джона Макклоя, — пишет Безыменский, — и без согласия на то остальных членов правительства вручил ему ставший впоследствии печально знаменитым “меморандум”, в котором предложил формирование немецких войск».
Вскоре после этого советником Аденауэра по военным вопросам стал генерал-лейтенант вермахта Адольф Хойзингер (Adolf Heusinger), участник Первой мировой войны, в том числе сражения под Верденом, где был ранен, награждён Железным крестом I и II степеней и ещё двумя орденами, с октября 1932 года служил гауптманом в оперативном отделе министерства рейхсвера, с августа 1937 года — в 1‑м (оперативном) отделе генерального штаба сухопутных сил, в звании подполковника участвовал в планировании военных кампаний в Польше, Дании, Норвегии, Франции и Голландии, 15 октября 1940 года полковник Хойзингер был назначен начальником оперативного отдела генерального штаба сухопутных сил, продолжал руководить им на Восточном фронте после вторжения в СССР, получил звание генерал-майора, с 10 июня 1944 года в звании генерал-лейтенанта стал исполняющим обязанности начальника генерального штаба сухопутных сил, присутствовал на совещании в ставке Гитлера 20 июля 1944 года и стоял рядом с фюрером, когда взорвалась бомба, был госпитализирован из-за полученных ранений, затем арестован гестапо по подозрению в причастности к заговору, но в октябре 1944 года выпущен на свободу и направлен в резерв фюрера. После войны Хойзингер выступал в качестве свидетеля на Нюрнбергском процессе, в 1948–1950 годах сотрудничал в «Организации Гелена».
