Луис Кинтана-Мурси – Люди. По следам наших миграций, приспособлений и поисков компромиссов (страница 47)

Изучение процесса эволюции нашего вида позволяет нам лучше понять не только то, кем мы являемся сегодня, со всеми нашими сходствами и различиями, но и наши взаимоотношения с болезнями. Совершенно естественно, что, работая в Институте Пастера – «храме микробиологии», – я заинтересовался инфекционными заболеваниями и решил разобраться, как в процессе эволюции патогены повлияли на геном человека и на его иммунный ответ. Используя подход, основанный на эволюционной генетике, я изучал происхождение и миграции людей, адаптацию разных популяций к меняющейся окружающей среде, и, наконец, способы, с помощью которых наш вид смог более или менее успешно защититься от патогенов – возбудителей инфекционных заболеваний.

Я чувствую себя обязанным многим людям или организациям: без них это путешествие – то есть написание этой книги – было бы невозможным. Прежде всего, я хотел бы поблагодарить Институт Пастера, ставший для меня родным домом уже двадцать два года назад, за доверие и поддержку, а также Национальный центр научных исследований и Коллеж де Франс. Спасибо также моим наставникам, официальным и неофициальным, – Сильване Сантакьяра-Бенеречетти, Луке Кавалли-Сфорца и Крису Тайлер-Смиту – образцам для подражания в их научном рвении, в их строгости и доброжелательности. Эта книга была бы невозможна и без моих коллег и сотрудников. Как ученый и как человек, я чувствую себя очень обязанным всем бывшим и нынешним работникам лаборатории эволюционной генетики человека за их вдохновенный труд, их терпение (особенно по отношению ко мне) и их преданность науке. Огромное спасибо всем, кто работал со мной, – у меня бы не получилось перечислить всех, не рискуя кого-то забыть, но я не могу не назвать тех коллег, с кем мы были особенно близки в работе: это Лоран Абель, Жан-Лоран Казанова́, Антуан Жессен, Эвелин Эйер, Оливье Нейроль, Франсуа Рено и Поль Вердю. Спасибо также и коллегам, которые согласились прочитать эту книгу и высказать свое мнение в процессе ее редактирования – это Жан-Пьер Шанжо, Ален Израэль, Этьен Патэн, Венсиан Пиренн, Максим Ротиваль и Филипп Сансонетти – и также Орели Бизио и Мари-Терез Висент за исправления во французском языке. Наконец, эта книга никогда бы не появилась на свет без постоянного содействия Жерома Бона, издательской помощи Марка Кирша и – last but not least – терпения, таланта и ободряющей, всегда полной оптимизма поддержки Одиль Жакоб.

Однако последняя моя мысленная благодарность будет обращена к истинным героям этого труда по популяционной генетике – рассматриваемым в ней популяциям людей, и в особенности земледельцам и охотникам-собирателям Центральной Африки, а также различным популяциям южной части Тихого океана. Без них мой труд был бы невозможен, и именно им я посвящаю эту книгу.

Библиография

Allison, A. C., «Protection Afforded by Sickle-Cell Trait against Subtertian Malareal Infection», Br. Med. J., 1, 4857 (1954), p. 290–294.

Anderson, S., Bankier, A. T., Barrell, B. G., de Bruijn, M. H., Coulson, A. R., Drouin, J., Eperon, I. C., et al., «Sequence and Organization of the Human Mitochondrial Genome», Nature, 290, 5806 (1981), p. 457–465.

Auton, A., Brooks, L. D., Durbin, R. M., Garrison, E. P., Kang, H. M., Korbel, J. O., Marchini, J. L., et al., «A Global Reference for Human Genetic Variation», Nature, 526, 7571 (2015), p. 68–74.

Bergstrom, A., McCarthy, S. A., Hui, R., Almarri, M. A., Ayub, Q., Danecek, P., Chen, Y., et al., «Insights into Human Genetic Variation and Population History from 929 Diverse Genomes», Science, 367, 6484 (2020).

Bycroft, C., Freeman, C., Petkova, D., Band, G., Elliott, L. T., Sharp, K., Motyer, A., et al., «The Uk Biobank Resource with Deep Phenotyping and Genomic Data», Nature, 562, 7726 (2018), p. 203–209.

Cann, R. L., Stoneking, M., Wilson, A. C., «Mitochondrial DNA and Human Evolution», Nature, 325, 6099 (1987), p. 31–36.

Cavalli-Sforza, L. L., Menozzi, P., Piazza, A., The History and Geography of Human Genes, Princeton, Princeton University Press, 1994.

Chimpanzee, Sequencing, and Analysis Consortium, «Initial Sequence of the Chimpanzee Genome and Comparison with the Human Genome», Nature, 437, 7055 (2005), p. 69–87.

Currat, M., Excoffier, L., «Modern Humans Did Not Admix with Neanderthals During Their Range Expansion into Europe», PLoS Biol., 2, 12 (2004), e421.

Darwin, C., On the Origin of Species by Means of Natural Selection, or Preservation of Favoured Races in the Struggle for Life, Londres, John Murray, 1859.

Darwin, C., The Descent of Man, and Selection in Relation to Sex, Londres, John Murray, 1871.

Enard, W., Przeworski, M., Fisher, S. E., Lai, C. S., Wiebe, V., Kitano, T., Monaco, A. P., Paabo, S., «Molecular Evolution of Foxp2, a Gene Involved in Speech and Language», Nature, 418, 6900 (2002), p. 869–872.

Fisher, R. A., The Genetical Theory of Natural Selection, Oxford, Clarendon Press, 1930.

Fu, Q., Li, H., Moorjani, P., Jay, F., Slepchenko, S. M., Bondarev, A. A., Johnson, P. L., et al., «Genome Sequence of a 45,000-Year-Old Modern Human from Western Siberia», Nature, 514,7523 (2014), p. 445–449.

Fu, W., O’Connor, T. D., Jun, G., Kang, H. M., Abecasis, G., Leal, S. M., Gabriel, S., et al., «Analysis of 6,515 Exomes Reveals the Recent Origin of Most Human Protein-Coding Variants», Nature, 493, 7431 (2013), p. 216–220.

Hajdinjak, M., Fu, Q., Hubner, A., Petr, M., Mafessoni, F., Grote, S., Skoglund, P., et al., «Reconstructing the Genetic History of Late Neanderthals», Nature, 555,7698 (2018), p. 652–656.

Haldane, J. B. S., «Disease and Evolution», Ric. Sci., 19 (Suppl. A) (1949), p. 68–76.

Hart, D. L., Clark, A. G., Principles of Population Genetics, Sunderland, Sinauer Associates, Inc. Publishers, 2007.

Higuchi, R., Bowman, B., Freiberger, M., Ryder, O. A., Wilson, A. C., «DNA Sequences from the Quagga, an Extinct Member of the Horse Family», Nature, 312, 5991 (1984), p. 282–284.

International Human Genome Sequencing, Consortium, «Finishing the Euchromatic Sequence of the Human Genome», Nature, 431, 7011 (2004), p. 931–945.

Johanson, D. C., White, T. D., Coppens, Y., «A New Species of the Genus Australopithecus (Primates: Hominidae) from the Pliocene of Eastern Africa», Kirtlandia, 28 (1978), p. 1–14.

Kimura, M., «Evolutionary Rate at the Molecular Level», Nature, 217, 5129 (1968), p. 624–626.

Kimura, M., The Neutral Theory of Molecular Evolution, Cambridge, Cambridge University Press, 1984.

Krings, M., Stone, A., Schmitz, R. W., Krainitzki, H., Stoneking, M., Paabo, S., «Neandertal DNA Sequences and the Origin of Modern Humans», Cell, 90, 1 (1997), p. 19–30.

Kuderna, L. F., Esteller-Cucala, P., Marques-Bonet, T., «Branching Out: What Omics Can Tell Us About Primate Evolution», Curr. Opin. Genet. Dev., 62 (2020), p. 65–71.

Kuhlwilm, M., de Manuel, M., Nater, A., Greminger, M. P., Krutzen, M., Marques-Bonet, T., «Evolution and Demography of the Great Apes», Curr. Opin. Genet. Dev., 41 (2016), p. 124–129.

Lander, E. S., Linton, L. M., Birren, B., Nusbaum, C., Zody, M. C., Baldwin, J., Devon, K., et al., «Initial Sequencing and Analysis of the Human Genome», Nature, 409, 6822 (2001), p. 860–921.

Landsteiner, K., «Uber Agglutinationserscheinungen Normalen Menschlichen Blutes», Wiener klinische Wochenschrift, 14 (1901), p. 1132–1134.

Lek, M., Karczewski, K. J., Minikel, E. V., Samocha, K. E., Banks, E., Fennell, T., O’Donnell-Luria, A. H., et al., «Analysis of Protein-Coding Genetic Variation in 60,706 Humans», Nature, 536, 7616 (2016), p. 285–291.

Lewontin, R. C., «The Apportionment of Human Diversity», in T. H. Dobzhansky, M. K. Hecht et W. C. Steere (dir.), Evolutionary Biology, New York, Appleton-Century-Crofts, 1972, p. 381–398.

Locke, D. P., Hillier, L. W., Warren, W. C., Worley, K. C., Nazareth, L. V., Muzny, D. M., Yang, S. P., et al., «Comparative and Demographic Analysis of Orang-Utan Genomes», Nature, 469, 7331 (2011), p. 529–533.

Mafessoni, F., Grote, S., de Filippo, C., Slon, V., Kolobova, K. A., Viola, B., Markin, S. V., et al., «A High-Coverage Neandertal Genome from Chagyrskaya Cave», Proc. Natl Acad. Sci. USA, 117, 26 (2020), p. 15132–15136.

Maixner, F., Krause-Kyora, B., Turaev, D., Herbig, A., Hoopmann, M. R., Hallows, J. L., Kusebauch, U., et al., «The 5300-Year-Old Helicobacter Pylori Genome of the Iceman», Science, 351, 6269 (2016), p. 162–165.

Mallick, S., Li, H., Lipson, M., Mathieson, I., Gymrek, M., Racimo, F., Zhao, M., et al., «The Simons Genome Diversity Project: 300 Genomes from 142 Diverse Populations», Nature, 538, 7624 (2016), p. 201–206.

Marques-Bonet, T., Ryder, O. A., Eichler, E. E., «Sequencing Primate Genomes: What Have We Learned?», Annu. Rev. Genomics Hum. Genet., 10 (2009), p. 355–386.

Meyer, M., Kircher, M., Gansauge, M. T., Li, H., Racimo, F., Mallick, S., Schraiber, J. G., et al., «A High-Coverage Genome Sequence from an Archaic Denisovan Individual», Science, 338, 6104 (2012), p. 222–226.

Perry, G. H., Yang, F., Marques-Bonet, T., Murphy, C., Fitzgerald, T., Lee, A. S., Hyland, C., et al., «Copy Number Variation and Evolution in Humans and Chimpanzees», Genome Res., 18, 11 (2008), p. 1698–1710.